公立はこだて未来大学では文化系32団体、体育系15団体のクラブ・サークルがあります。
運営・統括
文化系（32団体）
- brass FUN
- DARTS.FUN
- FUNGC
- FUN AI
- FUNラジ
- Illustrators
- Sound Create
- オーケストラ同好会
- クリエイティブコーディングサークル「ARTiS」
- 公立はこだて未来大学スマブラの会
- 茶華道部
- 軽音楽部
- 公立はこだて未来大学GATT
- 公立はこだて未来大学天文部
- 未来祭実行委員会
- 未来大学ポケモンだいすきクラブ
- FUN-BS
- FUN3D
- 未来工房
- 麻雀サークル
- FUN Exam Hub
- 劇団Null
- ガチャガチャサークル FuCa
- FUN Photo
- 公立はこだて未来大学ハードウェアサークル
- 公立はこだて未来大学競技プログラミング部FUN Coder
- FUN Poker
- Mariners’ Conference
- スプラトゥーンサークル FUNRush
- aiEDU JAPAN 函館
- 玩具研究会
- 公立はこだて未来大学DJサークル
体育系（15団体）
- Dance.Sarfy
- 公立はこだて未来大学クルージング部
- ストリートダンスサークル一気狂う
- バドミントン部
- 公立はこだて未来大学自動車部
- 公立はこだて未来大学卓球サークル
- 硬式テニス部
- バレーボールサークル
- 軟式野球部
- 函館学生連合〜息吹〜
- バスケットボールサークル
- サッカー・フットサルサークル
- 総合文化健康サークル
- ランニングサークル
- アウトドアサークル