公立はこだて未来大学では文化系38団体、体育系14団体のクラブ・サークルがあります。
運営・統括
文化系（38団体）
- Brass FUN
- DARTS.FUN
- FUNGC
- FUN AI
- FUNラジ
- Illustrators
- Sound Create
- オーケストラ同好会
- クリエイティブコーディングサークル「ARTiS」
- 公立はこだて未来大学スマブラの会
- 茶華道部
- 軽音楽部
- 公立はこだて未来大学サークルGATT
- 公立はこだて未来大学天文部
- 未来祭実行委員会
- 未来大ポケモンだいすきクラブ
- 自然探究会
- Film・Uncut
- Ichigo鉄道
- FUN-BS
- FUN3D
- 未来工房
- 麻雀サークル
- FUN Exam Hub
- 劇団Null
- ガチャガチャサークル「FuCa」
- FUN Photo
- 公立はこだて未来大学ハードウェアサークル
- FUN Coder
- FUN POKER
- Mariners’ Conference
- スプラトゥーンサークル「FUNRush」
- aiEDU JAPAN 函館
- 玩具研究会
- 公立はこだて未来大学DJサークル
- FUN-TRPG
- ハッカソンサークル
- 将棋部
体育系（14団体）
- ダンスサーフィー
- ストリートダンスサークル「一気狂う」
- バドミントン部
- 公立はこだて未来大学自動車部
- 公立はこだて未来大学卓球サークル
- 硬式テニス部
- FunFishing
- バレーボールサークル
- 軟式野球部
- 函館学生連合〜息吹〜
- バスケットボールサークル
- サッカー・フットサルサークル
- ランニングサークル
- FUN Cap